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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Biblioteca Rui Tendinha. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@incaper.es.gov.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
24/06/2019 |
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Data da última atualização: |
24/06/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PERON, F. N.; CALLONI, R.; VENTURA, J. A.; FERNANDES, P. M. B. |
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Afiliação: |
UFES; UFGRS; Jose Aires Ventura, Incaper; UFES. |
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Título: |
Bioinformatics approach to the study of the molecular behaviour of mealybug wilt of pineapple. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019. |
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DOI: |
10.17660/ActaHortic.2019.1239.22 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Mealybug wilt of pineapple (MWP) is a disease caused by the Pineapple mealybug wilt-associated virus (PMWaV) complex transmitted by Dysmicoccus brevipes and D. neobrevipes. MWP symptoms are characterized by root dessication, leaf wilting and consequent failure to produce a fruit. The molecular mechanisms involved in the pineapple-PMWaV interaction for MWP symptomatology are still unclear. In this work, mRNAs of asymptomatic and symptomatic pineapple plants were evaluated using Illumina RNA sequencing technology. From a total of 79 million reads per sample, 16,097 genes were identified using STAR aligner and HTseq for paired-end files. Differentially expressed genes (DEGs) between the evaluated groups were estimated using DESeq2 and edgeR, with an FDR cutoff of ≤0.05. A total of 207 DEGs were detected, with 61 upregulated and 146 downregulated in symptomatic plants infected by PMWaV-2. The methodologies improved by the assays presented in this article and the detected DEGs can substantiate further researches with pineapple and the MWP disease. |
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Palavras-Chave: |
Abacaxi. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; DESeq2; EdgeR; Pineapple; PMWaV; STAR; Transcriptomic. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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700 1 $aFERNANDES, P. M. B.
773 $tActa Horticulturae, 1239, p. 177-184, 2019.
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
19/12/2016 |
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Data da última atualização: |
10/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Publicação em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ALVES, F. de L.; GOMES, S. A.; VIAL, J. G; BALBINO, J. M. de S.; TEIXEIRA, C. P.; FORNAZIER, M. J.; COSTA, H.; PREZOTTI, L. C.; PACOVA, B. E. V. |
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Afiliação: |
Flavio de Lima Alves, Incaper; Sebastião Antônio Gomes, Incaper; José Gilberto Vial, Incaper; José Mauro de Sousa Balbino, Incaper; Cesar Pereira Teixeira, Incaper; Mauricio José Fornazier, Incaper; Helcio Costa, Incaper; Luiz Carlos Prezotti, Incaper; Braz Eduardo Vieira Pacova, INCAPER. |
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Título: |
Novos clones de Citrus spp. : laranjas, tangerinas e limões para o município de Guaçuí e região. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO INTERNO DE PESQUISA, DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO, 1., 2004, Vitória. Resumo das ações de pesquisa, desenvolvimento e inovações tecnológicas. Vitória, ES : Incaper, p. 113-114, 2005. (Incaper. Documentos, 140). |
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Idioma: |
Português |
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Palavras-Chave: |
Citricultura; Citros; Guaçuí (Município); PROFRUTAS. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
http://biblioteca.incaper.es.gov.br/digital/bitstream/item/1126/1/BRT-simposiointernodepesquisadesenvolvimentoeinovacao-Incaper140.pdf
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Marc: |
LEADER 00913nam a2200241 a 4500
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100 1 $aALVES, F. de L.
245 $aNovos clones de Citrus spp.$blaranjas, tangerinas e limões para o município de Guaçuí e região.$h[electronic resource]
260 $aIn: SIMPÓSIO INTERNO DE PESQUISA, DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO, 1., 2004, Vitória. Resumo das ações de pesquisa, desenvolvimento e inovações tecnológicas. Vitória, ES : Incaper, p. 113-114, 2005. (Incaper. Documentos, 140).$c2005
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Volume |
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